المهام والواجبات متعدد أهمها:

1-    الرقابة  والتدقيق على وصولات القبض ومستندات الصرف والقيد والتأكد من أن الصرف قد تم وفقآ  للتخصيص المعتمد في الموازنة .
2-    التأكد من صحة ترحيل المعاملات من والى السجلات المحاسبية الخاصة بها.
3-    الرقابة والتدقيق على  قوائم الرواتب والأجور والمخصصات والمصروفات الأخرى ومطابقتها لكافة التعليمات والقرارات المالية والمحاسبية .
4-    الرقابة على السلف وأعمال اللجان المؤقتة والسلف المستديمة  .
5-     المشاركة في عضوية اللجان المختلفة .
6-     المساهمة في أعمال الرقابة الداخلية وممارسة الصلاحيات .
7-    المشاركة في أعمال جرد الموجودات عن طريق مطابقة الموجودات في قوائم الجرد مع أرصدتها الدفترية (الفعلية).
8-    أنجاز الأعمال المكلف بها من قبل قسم الرقابة والتدقيق الداخلي والتي تخص طبيعة العمل الرقابي.
9-    القيام بعمليات الجرد المفاجئ للصناديق في الكلية ومطابقة الموجود الفعلي مع السجلات والاوليات .
10-   الإجابة على الاستفسارات الواردة من رئاسة الجامعة عن طريق الكتب الرسمية.
11-  القيام بالزيارات الرقابية على كافة الاقسام العلمية و الشعب و الوحدات الادارية ورفع تقارير بها إلى رئيس الدائرة .
12- استلام التقارير والملاحظات الواردة من الجهات الرقابية الخارجية (الوزارة / ديوان الرقابة المالية الإتحادي / مكتب المفتش العام ) عن طريق رئاسة الجامعة – قسم الرقابة والتدقيق الداخلي ومتابعة وأرسال الاجابات الى الجهات المعنية .
13- تدقيق حسابات الموازنة وصندوق التعليم العالي بشكل يومي لمستندات الصرف و القبض والقيد وشهري لموازين المراجعة و جداول المصروفات والايرادات والسلف والامانات و الحسابات الجارية مع السجلات الخاصه بها لكل حساب

14- تدقيق قوائم اجور المحاضرات للمحاضرين الخارجيين للدراسة الاولية و اجور المحاضرات والاشراف و المناقشه لطلبة الدراسات العليا لبرنامج ( الماجستير – الدكتوراه ).

15- المشاركة في الدورات الرقابية التي تعدها الجامعة و تشكيلاتها و كذلك ديوان الرقابة المالية.
16- انجاز الاعمال المكلف بها من قبل قسم الرقابة والتدقيق الداخلي والتي تخص العمل الرقابي.